Bioinformatics Department

Η Eυρωπαϊκή υποδομή Βιοπληροφορικής ELIXIR ενώνει τους κορυφαίους οργανισμούς βιοεπιστημών της Ευρώπης στη διαχείριση και διασφάλιση του αυξανόμενου όγκου δεδομένων που δημιουργούνται από δημόσια χρηματοδοτούμενη έρευνα.  Σε αυτό το πλαίσιο, συντονίζει, ενσωματώνει και διατηρεί πόρους Βιοπληροφορικής στα κράτη μέλη της υποδομής και επιτρέπει στους χρήστες ακαδημαϊκών/ερευνητικών ιδρυμάτων αλλά και βιομηχανιών να έχουν πρόσβαση σε υπηρεσίες που είναι ζωτικής σημασίας για την έρευνα και την ανάπτυξή τους. Οι πόροι που συγκεντρώνει ο οργανισμός περιλαμβάνουν βάσεις δεδομένων, εργαλεία λογισμικού, εκπαιδευτικό υλικό, χρήση υπολογιστικού νέφους και υπερυπολογιστές. Ο στόχος του ELIXIR είναι ο συντονισμός αυτών των πόρων έτσι ώστε να σχηματίζουν μια ενιαία υποδομή. Αυτή η υποδομή διευκολύνει τους επιστήμονες να βρίσκουν και να μοιράζονται δεδομένα, να ανταλλάσσουν εμπειρογνωμοσύνη και να συμφωνούν σε βέλτιστες πρακτικές [1].

Με πρωτοβουλία τριών Ιδρυμάτων (του Ινστιτούτου Νευρολογίας &Γενετικής Κύπρου, του Πανεπιστημίου Κύπρου και του Ινστιτούτου Γεωργικών Ερευνών) και με την υποστήριξη της Γενικής Διεύθυνσης Ευρωπαϊκών Προγραμμάτων, Συντονισμού και Ανάπτυξης, η Κύπρος από τον Ιούλιο του 2018 είναι μέλος (με το καθεστώς του παρατηρητή) του ELIXIR, το οποίο περιλαμβάνει ήδη 22 τακτικά μέλη και περισσότερους από 220 ερευνητικούς οργανισμούς όπως φαίνεται στον παρακάτω χάρτη.

Η συμμετοχή σε αυτή την υποδομή δίνει τη δυνατότητα στην κυπριακή επιστημονική κοινότητα που ασχολείται με την βιοϊατρική έρευνα και ανάπτυξη να συνεργάζεται με κορυφαίους ευρωπαίους εταίρους μέσα από τη δυνατότητα συμμετοχής σε consortia για υποβολή κοινών προτάσεων χρηματοδότησης στην Ευρωπαϊκή Ένωση. Επίσης, δίνεται η δυνατότητα ταχείας ενημέρωσης για τις τρέχουσες ή τις επερχόμενες εξελίξεις στους τομείς της Βιοπληροφορικής και των εφαρμογών της, τόσο σε επίπεδο έρευνας και εκπαίδευσης, όσο και στο επίπεδο της δυνατότητας βέλτιστης διαχείρισης των παραγόμενων δεδομένων.

Η Έδρα Βιοπληροφορικής του Ινστιτούτου Νευρολογίας & Γενετικής Κύπρου (ΙΝΓΚ) [2] συμμετέχει ενεργά στην δημιουργία του Κυπριακού Κόμβου της Ευρωπαϊκής Υποδομής Βιοπληροφορικής ELIXIR. Στο πλαίσιο αυτής της δραστηριοποίησης, έχει γίνει εφικτή η συμμετοχή του ΙΝΓΚ στο Ευρωπαϊκό Πρόγραμμα ELIXIR-CONVERGE, το οποίο χρηματοδοτείται από την Ευρωπαϊκή Επιτροπή για να βοηθήσει στην τυποποίηση της διαχείρισης δεδομένων βιοεπιστημών σε όλη την Ευρώπη. Για να επιτευχθεί αυτό, θα αναπτυχθεί μια εργαλειοθήκη διαχείρισης βιοϊατρικών δεδομένων κάτι που πέραν από την έρευνα, αναμένεται να τονώσει και την καινοτομία στη βιοϊατρική και τη βιοτεχνολογία.

[1] https://www.elixir-europe.org/
[2] Η Έδρα Βιοπληροφορικής του Ινστιτούτου Νευρολογίας και Γενετικής Κύπρου (ΙΝΓΚ) δημιουργήθηκε το 2016 με την υποστήριξη ευρωπαϊκής χρηματοδότησης (European Commission Research Executive Agency Grant BIORISE No. 669026 under the Spreading Excellence, Widening Participation, Science with and for Society Framework)